Dinas
- Dinas Kebersihan
- Dinas Kependudukan & Capil
- Dinas Kesehatan
- DInas Koperasi dan UKM
- Dinas Pariwisata
- Dinas Pekerjaan Umum
- Dinas Pendapatan
- Dinas Pendidikan
- Dinas Perhubungan
- Dinas Perikanan
- Dinas Perindag
- Dinas Pertanian
- Dinas Sosial
- Dinas Tata Kota
- Dinas Tenaga Kerja
Badan
- Badan Bencana
- Badan Kepegawaian
- Badan Kependudukan & KB
- Badan Pengelola Keuangan
- Bappekot
- BPPMD
- Inspektorat
Kantor
- Kantor Pengendalian Dampak Lingkungan
- Kantor Pelayanan Publik
- Kantor Perpustakaan dan Arsip
- Kantor Pengolahan Data Elektronik
Bagian
- Bagian Hukum
- Bagian Humas dan Protokoler
- Bagian Kerjasama
- Bagian Kesejahteraan Rakyat
- Bagian Organisasi dan Manajemen
- Bagian Tata Pemerintahan
- Bagian Tata Usaha Pimpinan dan Ekspedisi
- Bagian Umum dan Perlengkapan
Kecamatan
- Kecamatan Leitimur Selatan
- Kecamatan Nusaniwe
- Kecamatan Sirimau
- Kecamatan Teluk Ambon Baguala
- Kecamatan Teluk Ambon
Kelurahan
- Kelurahan Batu Meja
- Kelurahan Karpan
- Kelurahan Silale
- Kelurahan Urimessing
- Kelurahan Waihoka
- Kelurahan Wainitu
- Kelurahan Ahusen
- Kelurahan Amantelu
- Kelurahan Batu Gajah
- Kelurahan Benteng
- Kelurahan Honipopu
- Kelurahan Kudamati
- Kelurahan Lateri
- Kelurahan Mangga Dua
- Kelurahan Nusaniwe
- Kelurahan Pandan Kasturi
- Kelurahan Rijali
- Kelurahan Tihu
- Kelurahan Uritetu
- Kelurahan Waihaong